Psychologické poradenství pro studenty PEF zajišťuje Katedra psychologie PEF. Pedagogové katedry s psychologickým vzděláním nabízí bezplatné psychologické poradenství v rozsahu obvykle jednoho, maximálně dvou setkání, jejichž náplní je především aktuální pomoc v krizových situacích, a to především se zaměřením na zorientování studenta v problému a zvládnutí obtíží v oblasti prožívání – většinou nadměrného stresu, strach či smutku, který studentovi brání v plnohodnotném životě a způsobuje mu těžko zvladatelné obtíže.
Psychologické poradenství je zaměřeno především na oblasti problémů spojených se vzdělávacím procesem (pedagogicko-psychologická problematika), dále pak na vztahové problémy (mezigenerační, partnerské apod.), krize z očekávaných životních změn s přesahem do krizí vývojových (adaptační problémy), problematiku závislostí, poruch příjmu potravy, problematiku týrání a zneužívání.
Z kapacitních a specializačních důvodů nemůže katedra nabídnout dlouhodobější poradenství či psychoterapii. Rovněž nenabízí speciálně-pedagogické poradenství pro studenty se specifickými vzdělávacími potřebami ani pomoc s administrativní agendou ohledně studia.